Mikrofiliz yetiştiriciliğinde en sık karşılaşılan iki temel hatanın kaynağı hatalı tohum miktarıdır. Gereğinden fazla tohum ekildiğinde filizler birbirini aşırı sıkıştırır; kök boğazı ve gövdeler arasında hava sirkülasyonu kesildiği için küflenme başlar. Yeni başlayan yetiştiricilerin en yaygın sorunu budur. Gereğinden az tohum ekildiğinde ise filizler seyrek kalır; dik durmak için birbirlerine destek olamadıklarından kolayca devrilir ve tepsiden beklenen hasat verimi alınamaz.
İdeal tohum miktarını tepsinizin yüzey alanı ile tohum tanelerinin büyüklüğü belirler. Örneğin iri taneli ayçiçeği tohumunda, aynı tepsi yüzeyi için brokoliye kıyasla gramaj bazında yaklaşık beş kat daha fazla tohuma ihtiyaç duyulur. En yoğun ekim sıklığına sahip tür ise buğday çimidir. Dolayısıyla “bir avuç” veya “bir tutam” gibi göz kararı ölçüler sağlıklı bir yetiştirme için yetersiz kalmaktadır.
İkinci kritik faktör ise doğru zamanlamadır. Karanlık evre süresi ve hasat olgunluğu her türde farklılık gösterir. Örneğin turp 6 günde hasat olgunluğuna ulaşırken ayçiçeğinde bu süre 12 güne kadar uzayabilir. Belirli bir güne veya öğüne taze filiz yetiştirmek istediğinizde ekim gününü geriye doğru planlamanız gerekir.